More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1887 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  407  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  35.05 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  33.88 
 
 		 202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 196 aa  105  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4520  regulatory protein TetR  34.32 
 
 		 228 aa  101  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 285 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  35.5 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 196 aa  98.6  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 201 aa  98.2  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 220 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  33.51 
 
 		 211 aa  94.7  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 194 aa  93.6  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 200 aa  92  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  31.95 
 
 		 209 aa  92  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 223 aa  89.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 188 aa  87.8  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  34.91 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 201 aa  85.1  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  30.16 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1833  regulatory protein, TetR  30.86 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3999  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  24.1 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 223 aa  72  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 204 aa  72  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  31.63 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4009  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  31.12 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2063  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  35.51 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 226 aa  62  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 241 aa  62  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  29.03 
 
 		 224 aa  62  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  31.85 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  25.67 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>