More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4520 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4520  regulatory protein TetR  100 
 
 		 228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  43.41 
 
 		 223 aa  132  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 234 aa  105  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  32.69 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 212 aa  86.3  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  32.69 
 
 		 211 aa  85.9  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  30.34 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  29.94 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2063  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  29.82 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  29.89 
 
 		 209 aa  71.6  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 226 aa  67  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  55.1 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1833  regulatory protein, TetR  29.34 
 
 		 236 aa  62  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3566  regulatory protein TetR  28 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  23.39 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  25.58 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2057  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 188 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  57.14 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  46.38 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0289  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 203 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3668  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0040426  hitchhiker  0.0000000599644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  26.59 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  52.17 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>