More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0913 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  395  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 202 aa  95.1  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 224 aa  94.4  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 202 aa  91.7  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 223 aa  89  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 196 aa  86.3  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  26.84 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 234 aa  72  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 223 aa  72  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603343 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  25.89 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
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NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  24.5 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  39.1 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  26.34 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  25.82 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0304  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 201 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.826155  hitchhiker  0.000375508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 211 aa  67  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 201 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 200 aa  67  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0324  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 201 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3668  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0040426  hitchhiker  0.0000000599644 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3423  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0289  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2579  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0013  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0006  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0589242  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3781  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3117  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100627  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3842  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1978  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3531  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3103  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.454868  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
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NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  22.95 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  33.85 
 
 		 390 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  25.39 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 189 aa  62  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
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