More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1804 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 189 aa  387  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  52.22 
 
 		 207 aa  209  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  46.49 
 
 		 208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 214 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 200 aa  111  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 194 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 211 aa  101  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 201 aa  98.6  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 204 aa  95.1  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 219 aa  87  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
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NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 233 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 211 aa  85.9  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 189 aa  84.7  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
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NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 212 aa  84.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  26.52 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 202 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
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NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
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NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
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NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 256 aa  74.7  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  26.6 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
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NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  26.82 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 240 aa  72  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 224 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 224 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  24.31 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  27.91 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3212  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4794  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 228 aa  67.8  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  25 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3375  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 216 aa  67  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2195  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
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NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 770 aa  66.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A0289  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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