More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2017 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 236 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  92.86 
 
 		 236 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  84.75 
 
 		 236 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  73.93 
 
 		 233 aa  331  5e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  76.92 
 
 		 211 aa  328  6e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4794  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 216 aa  72  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  23.88 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  20.67 
 
 		 770 aa  65.5  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 207 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  25.69 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  21.67 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  26.78 
 
 		 211 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 209 aa  62  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 207 aa  62  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  25.31 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  31.37 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  24.56 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
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NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  22.39 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  28.32 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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