More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1684 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  70.65 
 
 		 213 aa  305  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4794  transcriptional regulator, TetR family  63.76 
 
 		 232 aa  265  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  63 
 
 		 240 aa  241  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  36.55 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  36.22 
 
 		 236 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 		 260 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  34.2 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2454  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 256 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  27.37 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 219 aa  62  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 209 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 214 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 332 aa  61.6  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  33.91 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 770 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  20.42 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  23.47 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2071  TetR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  24.74 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  46.67 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  25 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>