More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1571 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  413  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  48.9 
 
 		 188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  41.71 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 208 aa  165  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 209 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  29.83 
 
 		 190 aa  109  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 211 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 226 aa  105  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2195  transcriptional regulator, TetR family  38.92 
 
 		 189 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 202 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 224 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 214 aa  101  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  30.53 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 219 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 215 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 194 aa  97.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 211 aa  96.3  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 246 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  31.96 
 
 		 197 aa  96.3  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 208 aa  95.9  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 212 aa  95.1  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 240 aa  94.7  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 233 aa  94.7  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 256 aa  93.2  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 234 aa  92.8  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  29.95 
 
 		 252 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  32.62 
 
 		 207 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  91.7  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 223 aa  91.7  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 204 aa  91.3  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 260 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 228 aa  90.1  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 227 aa  89.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  32.09 
 
 		 198 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  30.05 
 
 		 200 aa  88.6  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 206 aa  88.2  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 238 aa  88.2  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  32.63 
 
 		 211 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 770 aa  87.8  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  30.81 
 
 		 196 aa  85.9  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 285 aa  85.5  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 246 aa  85.1  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 235 aa  85.1  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 209 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 200 aa  84.7  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 220 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 202 aa  84.7  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  29.38 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  31.58 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>