More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1898 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  479  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  61.76 
 
 		 227 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  56.56 
 
 		 227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  43.9 
 
 		 225 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  40.11 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  39.01 
 
 		 207 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 201 aa  108  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 211 aa  99  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 202 aa  92  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 210 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 225 aa  89.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  32.62 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  27.22 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  31.03 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  23.59 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 770 aa  63.2  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  27.66 
 
 		 197 aa  62  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 200 aa  62  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 234 aa  62  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 183 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0615  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  25.91 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5040  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5585  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5489  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.152228  hitchhiker  8.2338e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5433  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.944120000000001e-18 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3449  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  30.95 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  26.37 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  29.7 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 412 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 412 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>