More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3449 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3449  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 210 aa  427  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3340  transcriptional regulator, TetR family  80.77 
 
 		 210 aa  356  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  64.04 
 
 		 209 aa  275  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  63.55 
 
 		 209 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5433  transcriptional regulator, TetR family  63.05 
 
 		 209 aa  272  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.944120000000001e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  63.05 
 
 		 209 aa  272  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5040  TetR family transcriptional regulator  63.05 
 
 		 209 aa  272  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  63.05 
 
 		 209 aa  272  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  63.05 
 
 		 209 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  63.55 
 
 		 209 aa  271  6e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  62.56 
 
 		 209 aa  271  7e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5489  transcriptional regulator, TetR family  63.55 
 
 		 209 aa  270  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.152228  hitchhiker  8.2338e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5585  TetR family transcriptional regulator  62.89 
 
 		 200 aa  265  4e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 222 aa  118  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  29.08 
 
 		 278 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 212 aa  88.6  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0291  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  24.87 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  21.93 
 
 		 225 aa  72  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2925  regulatory protein TetR  20.53 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 240 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1920  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  25.32 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  27.34 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  24.1 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  24.64 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 291 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0976  regulatory protein TetR  30.19 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00018682  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  21.24 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 233 aa  52  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4449  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 237 aa  52  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 237 aa  52  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  23.12 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 256 aa  51.6  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 770 aa  51.6  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 193 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 200 aa  51.6  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 307 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02226  transcriptional regulator, TetR family protein  25.27 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.972925  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  24.11 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  24.11 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  24.11 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2446  regulator AmrR  29.25 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  24.11 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  24.11 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>