More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0976 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0976  regulatory protein TetR  100 
 
 		 204 aa  417  1e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00018682  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 189 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  22.29 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  58.33 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  27.56 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  24.52 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  46.94 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 269 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 226 aa  53.9  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5683  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17527  hitchhiker  0.003772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.92 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  28.09 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>