More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1398 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 195 aa  395  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1439  TetR family transcriptional regulator  48.9 
 
 		 196 aa  179  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.187037  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2337  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784236 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1702  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  25.34 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  42.59 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 212 aa  57  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1453  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  41.51 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3340  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  23.89 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  20.5 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  22.8 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3449  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 307 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 228 aa  53.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  21.21 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5433  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.944120000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>