More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0652 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 190 aa  387  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  76.32 
 
 		 190 aa  307  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  67.2 
 
 		 190 aa  265  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  66.14 
 
 		 190 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  67.2 
 
 		 190 aa  265  4e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  67.2 
 
 		 190 aa  265  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  67.2 
 
 		 190 aa  265  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  67.2 
 
 		 190 aa  263  8e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  67.2 
 
 		 190 aa  263  8e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  67.2 
 
 		 190 aa  263  8e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  67.2 
 
 		 190 aa  263  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 190 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 190 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  62.09 
 
 		 227 aa  240  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 202 aa  141  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5683  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17527  hitchhiker  0.003772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  36.67 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 231 aa  62  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  20.9 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  26.39 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  26.76 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  26.9 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 188 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 188 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 220 aa  57  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  29.82 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  27.27 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5641  regulatory protein, TetR  34.52 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2368  TetR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000142624 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3254  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  40.62 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.52 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.52 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.52 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>