More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1211 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 227 aa  467  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  61.75 
 
 		 190 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  62.09 
 
 		 190 aa  240  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  55.49 
 
 		 190 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  55.49 
 
 		 190 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  55.49 
 
 		 190 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  55.49 
 
 		 190 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  55.49 
 
 		 190 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  55.49 
 
 		 190 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  55.49 
 
 		 190 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  55.49 
 
 		 190 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 190 aa  211  7e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 190 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 190 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 202 aa  121  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5683  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17527  hitchhiker  0.003772 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 189 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 189 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 770 aa  65.5  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 247 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 255 aa  62  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 199 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  40.74 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  24.5 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  25.97 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  20.13 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2365  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227272  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3722  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4844  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 207 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  22.68 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  23.64 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  41.82 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1818  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671958  normal  0.199135 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 190 aa  53.5  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 198 aa  53.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 193 aa  53.5  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>