More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2991 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 188 aa  386  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 188 aa  386  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  97.34 
 
 		 188 aa  377  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  97.34 
 
 		 188 aa  377  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  87.77 
 
 		 188 aa  348  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  87.77 
 
 		 188 aa  348  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  87.77 
 
 		 188 aa  348  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  87.77 
 
 		 188 aa  348  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  95.21 
 
 		 188 aa  349  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  87.77 
 
 		 188 aa  348  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 193 aa  138  4.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 192 aa  95.5  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 190 aa  94.7  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 197 aa  92.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 192 aa  92.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 203 aa  90.9  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 191 aa  85.5  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  27.6 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  24.35 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  26.6 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 248 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  26.98 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 248 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 248 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  26.74 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  21.6 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  20.88 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  26.81 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  24.82 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  20.32 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  29.7 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  21.81 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  26.03 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  21.81 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  20.11 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 291 aa  57.8  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 190 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>