More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3459 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  387  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  98.96 
 
 		 193 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  77.6 
 
 		 194 aa  309  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3536  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 208 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1600  TetR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0658  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 232 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1176  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1100  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1771  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0807  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2387  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 206 aa  114  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2712  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3522  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9297  putative transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2310  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.145827  normal  0.0377448 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  42.71 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2551  regulatory protein TetR  26.8 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  26.75 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  21.81 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  21.81 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  21.28 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 324 aa  58.2  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  21.28 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  21.43 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  29.41 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2894  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  28.08 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  40 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2204  putative transcriptional regulator  28.77 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  28.41 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  28.7 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3581  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  23.62 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>