More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002240 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  100 
 
 
211 aa  434  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  94.31 
 
 
211 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  72.51 
 
 
242 aa  324  6e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  57 
 
 
214 aa  244  4.9999999999999997e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
215 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
215 aa  198  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
215 aa  198  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 
215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
215 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  43.35 
 
 
215 aa  191  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4479  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
215 aa  190  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  44.33 
 
 
218 aa  189  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  44.33 
 
 
217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4284  transcriptional regulator, TetR family  42.36 
 
 
215 aa  187  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000936887 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0059  TetR family transcriptional regulator  42.36 
 
 
215 aa  187  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4339  TetR family transcriptional regulator  42.36 
 
 
215 aa  187  7e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
211 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  40.39 
 
 
220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3614  regulatory protein, TetR  41.87 
 
 
215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0103  TetR family transcriptional regulator  41.87 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.462043 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  41.26 
 
 
213 aa  178  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 
218 aa  159  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5344  TetR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
223 aa  142  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4186  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
245 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
227 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
221 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5169  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0462  putative transcriptional regulator  35.68 
 
 
215 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04820  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  35.03 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0419  transcriptional reguator, TetR family  34.85 
 
 
220 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1491  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 
235 aa  115  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 
236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 
239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  32.3 
 
 
231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 
241 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
239 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
239 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
239 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
244 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
252 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
239 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
252 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
241 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
251 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
252 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
251 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
252 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
239 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
239 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
191 aa  106  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0349  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 
237 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
239 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
253 aa  101  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
208 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4167  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 
247 aa  96.7  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0825  TetR family transcriptional regulator  25.96 
 
 
222 aa  96.3  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  25.59 
 
 
220 aa  96.3  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4025  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
219 aa  92  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0535  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
217 aa  91.3  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0588697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0551  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 
220 aa  91.3  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3496  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 
223 aa  89  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
204 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
204 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
205 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
204 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  30.69 
 
 
205 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  29.24 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1581  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 
223 aa  79  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.223478 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5452  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 
220 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1089  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
227 aa  77  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 
213 aa  74.7  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4170  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0130344  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01158  transcriptional regulator PhaD  37.5 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334041  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
324 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 
195 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
195 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  37.31 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_0562  transcriptional regulator, TetR family  24.08 
 
 
197 aa  53.9  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242532  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
226 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  32.5 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
226 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
226 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
307 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  28.41 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
333 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  28.42 
 
 
201 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal 
 
 
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NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 
206 aa  52  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.693202 
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
191 aa  51.6  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
216 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
216 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal 
 
 
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