More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1089 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1089  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5452  TetR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 220 aa  161  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4284  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936887 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0059  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4479  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4339  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  27.91 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4186  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  102  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0103  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.462043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 221 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3614  regulatory protein, TetR  27.78 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0462  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04820  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5169  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 221 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5344  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 242 aa  89.4  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  26.32 
 
 		 211 aa  88.6  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 252 aa  88.2  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 238 aa  88.2  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0419  transcriptional reguator, TetR family  29.06 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  26.47 
 
 		 214 aa  86.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 218 aa  85.5  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  29.06 
 
 		 220 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3496  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  26.64 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0551  transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0535  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0588697 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0825  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4025  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  30.85 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  27.93 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0349  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4170  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0130344  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4167  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1581  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.223478 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1491  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2057  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1960  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01158  transcriptional regulator PhaD  28.97 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334041  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  40.28 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
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NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 332 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010333  Caul_5380  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768843  normal  0.61228 
 
 
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NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
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NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  38.81 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 211 aa  49.3  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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