More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0108 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  441  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4479  TetR family transcriptional regulator  77.62 
 
 		 215 aa  345  3e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  77.14 
 
 		 215 aa  345  3e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4339  TetR family transcriptional regulator  77.62 
 
 		 215 aa  345  3e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4284  transcriptional regulator, TetR family  77.62 
 
 		 215 aa  345  3e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936887 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0059  TetR family transcriptional regulator  77.62 
 
 		 215 aa  345  3e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273669  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  76.92 
 
 		 215 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  76.92 
 
 		 215 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  76.44 
 
 		 215 aa  333  7.999999999999999e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  76.44 
 
 		 215 aa  333  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  73.93 
 
 		 211 aa  328  3e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  73.56 
 
 		 220 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  68.57 
 
 		 217 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  69.38 
 
 		 218 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0103  TetR family transcriptional regulator  69.05 
 
 		 225 aa  304  5.0000000000000004e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.462043 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  68.42 
 
 		 215 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3614  regulatory protein, TetR  68.1 
 
 		 215 aa  292  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  41.67 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 211 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 242 aa  176  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  42.27 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0462  putative transcriptional regulator  36.87 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04820  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0419  transcriptional reguator, TetR family  34.6 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  33.65 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4186  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 245 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5169  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5344  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 241 aa  131  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 239 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 239 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 239 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 239 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 239 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 239 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 252 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 252 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 252 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 239 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 236 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  31.19 
 
 		 231 aa  121  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0825  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3496  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 223 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4167  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 247 aa  104  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0551  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0535  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0588697 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4025  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0349  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1491  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 209 aa  99  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1089  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 204 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1581  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.223478 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 191 aa  93.2  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 204 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 206 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  25.84 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 205 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01158  transcriptional regulator PhaD  30 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334041  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  30.06 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5452  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4170  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0130344  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 277 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  18.89 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  31.68 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>