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for query gene Sputcn32_3900 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



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PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0059  TetR family transcriptional regulator  96.74 
 
 		 215 aa  433  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273669  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4284  transcriptional regulator, TetR family  96.74 
 
 		 215 aa  433  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936887 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4339  TetR family transcriptional regulator  96.74 
 
 		 215 aa  433  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4479  TetR family transcriptional regulator  96.28 
 
 		 215 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  90.7 
 
 		 215 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  90.23 
 
 		 215 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  90.23 
 
 		 215 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  89.77 
 
 		 215 aa  400  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  83.1 
 
 		 220 aa  375  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  77.14 
 
 		 213 aa  345  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0103  TetR family transcriptional regulator  73.46 
 
 		 225 aa  333  9e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.462043 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  73.81 
 
 		 218 aa  329  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  72.04 
 
 		 211 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  70.89 
 
 		 217 aa  322  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  71.9 
 
 		 215 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3614  regulatory protein, TetR  70.95 
 
 		 215 aa  315  4e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  43.87 
 
 		 214 aa  195  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  44.79 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  43.63 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  35.58 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4186  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0419  transcriptional reguator, TetR family  34.13 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 221 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0462  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 215 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5169  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 221 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04820  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5344  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 223 aa  128  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 239 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  34.76 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 244 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0825  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 222 aa  111  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0551  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0535  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0588697 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 220 aa  105  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0349  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 237 aa  104  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3496  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 223 aa  101  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4025  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 219 aa  98.6  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  28.16 
 
 		 204 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1089  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 227 aa  97.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1491  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 209 aa  97.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1581  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.223478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 191 aa  95.9  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4167  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 247 aa  95.9  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 205 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  32.73 
 
 		 205 aa  92  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 213 aa  86.3  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5452  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
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NC_011138  MADE_01158  transcriptional regulator PhaD  30.43 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334041  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
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NC_009511  Swit_4170  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0130344  normal  0.052898 
 
 
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NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
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NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 185 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
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NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 275 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
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NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  29.2 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 291 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
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NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 195 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 195 aa  51.6  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  31.17 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
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NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  29.7 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  33.77 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_3559  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  24.27 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00735263  normal  1 
 
 
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