More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2735 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
242 aa  504  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  73.93 
 
 
211 aa  328  4e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  72.51 
 
 
211 aa  309  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  56.04 
 
 
214 aa  240  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  43.6 
 
 
215 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  45.02 
 
 
218 aa  194  9e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
215 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
215 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
215 aa  192  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
215 aa  192  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0059  TetR family transcriptional regulator  42.58 
 
 
215 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4479  TetR family transcriptional regulator  42.58 
 
 
215 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4284  transcriptional regulator, TetR family  42.58 
 
 
215 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000936887 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4339  TetR family transcriptional regulator  42.58 
 
 
215 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  41.63 
 
 
215 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3614  regulatory protein, TetR  42.11 
 
 
215 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  42.58 
 
 
217 aa  180  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0103  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
225 aa  179  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.462043 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  39.71 
 
 
220 aa  177  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
213 aa  176  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
211 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
221 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 
221 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
221 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5169  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
221 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5344  TetR family transcriptional regulator  36.1 
 
 
223 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  37.32 
 
 
220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0462  putative transcriptional regulator  37.77 
 
 
215 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04820  TetR family transcriptional regulator  37.77 
 
 
215 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4186  TetR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
245 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0419  transcriptional reguator, TetR family  35.29 
 
 
220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 
239 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  30.1 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
238 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
191 aa  108  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 
241 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
252 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
251 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
251 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  31.92 
 
 
239 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  31.92 
 
 
239 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
252 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  31.92 
 
 
239 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  31.92 
 
 
239 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
241 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
252 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  31.92 
 
 
239 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
252 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  31.92 
 
 
239 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
208 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
244 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1491  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
209 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
253 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
239 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0825  TetR family transcriptional regulator  28.84 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0349  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 
237 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4167  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 
247 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3496  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 
223 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4025  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 
219 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0551  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
220 aa  86.3  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 
220 aa  86.3  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0535  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
217 aa  86.3  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0588697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1581  TetR family transcriptional regulator  25.35 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.223478 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  30.05 
 
 
204 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  31.89 
 
 
205 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
204 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5452  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1089  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4170  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0130344  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01158  transcriptional regulator PhaD  27.27 
 
 
221 aa  63.5  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334041  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  25 
 
 
204 aa  55.8  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.77 
 
 
217 aa  55.1  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
210 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  30.53 
 
 
201 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.87 
 
 
217 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.87 
 
 
217 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.87 
 
 
217 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.87 
 
 
217 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.87 
 
 
217 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 
215 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31 
 
 
215 aa  52.8  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31 
 
 
215 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31 
 
 
215 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal 
 
 
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NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31 
 
 
215 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal 
 
 
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NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31 
 
 
215 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008346  Swol_1334  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
241 aa  52.8  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
324 aa  52.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000855252 
 
 
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