More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10920 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  400  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 198 aa  125  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 193 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 193 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 193 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  38.76 
 
 		 194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 174 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4249  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 191 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.399807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3794  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.549336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3867  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3798  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164802  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 291 aa  82  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  34.3 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 332 aa  75.5  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3664  regulatory protein, TetR  35.96 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  40.78 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  33.96 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  53.45 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1170  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  51.72 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  35.79 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  36.79 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  46.43 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3574  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  42.47 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03122  DNA-binding transcriptional regulator  41.1 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0442  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.671353  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3647  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  41.1 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0126984  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0442  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  41.1 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3457  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  41.1 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03073  hypothetical protein  41.1 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.807649  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4581  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  41.1 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00305215  normal  0.159786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3749  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  41.1 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000431628  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3559  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  41.1 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00735263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>