More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0589 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 189 aa  145  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  44.25 
 
 		 201 aa  135  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3798  TetR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 191 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164802  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3794  TetR family transcriptional regulator  41.34 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.549336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3867  TetR family transcriptional regulator  41.34 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4249  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.399807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  39.01 
 
 		 203 aa  85.9  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  33.15 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
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NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3664  regulatory protein, TetR  32.18 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1170  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  40.79 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  44.44 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
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NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
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NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 290 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
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NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
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NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
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NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2627  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1774  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  28.57 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 310 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 260 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 290 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
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NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 290 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 290 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
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NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 290 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 290 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 291 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
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NC_007493  RSP_0185  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141931  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
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NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
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NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4067  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_1818  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671958  normal  0.199135 
 
 
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NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4323  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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