More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8489 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  398  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  48.66 
 
 		 221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  48.11 
 
 		 222 aa  158  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  41.36 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  44.39 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 199 aa  139  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  39.8 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  38.38 
 
 		 219 aa  135  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  39.46 
 
 		 221 aa  134  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  39.79 
 
 		 207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  43.01 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2853  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 195 aa  121  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  37.63 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 269 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 209 aa  118  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  39.27 
 
 		 207 aa  118  7e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  44.57 
 
 		 211 aa  115  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 214 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 216 aa  111  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 197 aa  101  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  34.38 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  37.85 
 
 		 203 aa  99.4  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 207 aa  97.8  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 195 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  36 
 
 		 214 aa  95.9  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 213 aa  89.4  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5005  transcriptional regulator, TetR family  34.24 
 
 		 229 aa  88.2  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1940  AcrR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.682868  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  37.16 
 
 		 346 aa  72.8  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  22.53 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  36.67 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  49.15 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3014  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00422654  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6034  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  40 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  29.41 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1965  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  38.75 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5178  putative transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  hitchhiker  0.00157317 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  48.48 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 255 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2129  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17920  transcriptional regulator, tetR family  43.94 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.330701  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  45.36 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>