More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2129 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2129  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2619  HTH-type luminescence regulator LitR  33.89 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03459  hypothetical protein  28.5 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002553  quorum-sensing regulator of virulence HapR  25.7 
 
 		 183 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0116  hemagglutinin/protease regulatory protein  52.63 
 
 		 68 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  24.64 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  22.88 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  22.88 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  22.88 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  31.78 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  22.88 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  22.88 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  22.88 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 244 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 238 aa  52.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 259 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 248 aa  52  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4596  regulatory protein TetR  37.5 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  33.73 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  36.49 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1946  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  hitchhiker  0.00972871 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  28.79 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  22.6 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  34.74 
 
 		 278 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0039  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1210  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0313613  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  56.6 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  29.01 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  33.7 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 254 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  29.63 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  19.86 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1492  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 239 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0796  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 239 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  27.27 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2113  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 239 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.473372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1810  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 239 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  28.68 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  28.68 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0381  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 239 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  28.68 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  28.68 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  28.68 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  36.36 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  36.36 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  20.78 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  20.31 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  29.9 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  23.39 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  44.93 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  28.31 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>