76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3120 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  401  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  96.3 
 
 		 202 aa  213  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  76.71 
 
 		 355 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  76.71 
 
 		 355 aa  118  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  75.32 
 
 		 355 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  75.34 
 
 		 355 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 205 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  66.67 
 
 		 333 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  75.34 
 
 		 299 aa  114  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  71.23 
 
 		 355 aa  112  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  62.14 
 
 		 359 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  75 
 
 		 303 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  53.25 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  51.95 
 
 		 368 aa  78.2  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  47.37 
 
 		 368 aa  78.2  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  50.65 
 
 		 368 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  51.95 
 
 		 356 aa  75.5  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  66.1 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  50.65 
 
 		 252 aa  74.3  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  50.65 
 
 		 395 aa  74.7  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  47.37 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  50 
 
 		 357 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  49.35 
 
 		 370 aa  71.6  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  50.7 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  48.68 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  34.17 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  44.68 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  42.5 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  42.86 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  39.44 
 
 		 355 aa  62  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  41.25 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4436  hypothetical protein  48 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1131  hypothetical protein  38.36 
 
 		 171 aa  57  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.907939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  38.16 
 
 		 355 aa  55.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  41.76 
 
 		 342 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2702  hypothetical protein  38.36 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  40.78 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  71.88 
 
 		 161 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  35 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5005  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 229 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  37.88 
 
 		 341 aa  49.7  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  37.88 
 
 		 341 aa  49.3  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  37.88 
 
 		 341 aa  48.9  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  36.92 
 
 		 350 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  26.27 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3430  hypothetical protein  44.26 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 200 aa  44.7  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>