More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0934 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 209 aa  426  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  54.68 
 
 		 221 aa  226  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2853  transcriptional regulator, TetR family  51.91 
 
 		 195 aa  191  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  47.4 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  42.49 
 
 		 216 aa  145  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  43.41 
 
 		 222 aa  142  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  38.51 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  37.69 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 214 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  34.5 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  35.78 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  39.16 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  31.44 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 269 aa  108  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  31.75 
 
 		 212 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 196 aa  101  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  36.6 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5005  transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 229 aa  99.4  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143864  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 		 205 aa  95.1  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  30.39 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 207 aa  91.3  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 189 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 195 aa  87.4  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 200 aa  84.7  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  32.94 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1940  AcrR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.682868  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 280 aa  62  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2015  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.997895  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  29.78 
 
 		 260 aa  58.5  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  34.11 
 
 		 346 aa  58.2  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2859  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.111234  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 291 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  23.88 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 176 aa  52.4  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 187 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4158  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 445 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22250  transcriptional regulator  29.27 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0446991  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.37 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1668  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  23.81 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.37 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.37 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 307 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  23.92 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  23.92 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>