More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2338 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 213 aa  420  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  64.77 
 
 		 200 aa  232  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  46.77 
 
 		 203 aa  148  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  45.99 
 
 		 214 aa  144  8.000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 193 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 195 aa  102  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 222 aa  94.7  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 196 aa  94.7  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 221 aa  92  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  32.39 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 203 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 269 aa  81.6  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2853  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  30.73 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  31.31 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  22.1 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.89 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5005  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  37 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.84 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  34.86 
 
 		 260 aa  52.8  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 188 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 188 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 245 aa  52  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1427  TetR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.286714  hitchhiker  0.000126282 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  45.9 
 
 		 346 aa  51.6  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  31.25 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  46 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1158  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2710  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.466457  normal  0.498996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1292  regulatory protein TetR  34.29 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3562  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1454  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3559  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  25 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00735263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2950  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171699 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  31.67 
 
 		 252 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  24.74 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3647  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  25.13 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0126984  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 280 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03122  DNA-binding transcriptional regulator  25.13 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4581  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  25.13 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00305215  normal  0.159786 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 243 aa  48.9  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03073  hypothetical protein  25.13 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.807649  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0081  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 231 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6683  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3749  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  25.13 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000431628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>