More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4700 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 224 aa  447  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  82.55 
 
 		 211 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  53.3 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  38.1 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  38.97 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 214 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 216 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 218 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 216 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  35.07 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  38.59 
 
 		 222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 199 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  39.01 
 
 		 223 aa  111  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5005  transcriptional regulator, TetR family  35.61 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  35.61 
 
 		 207 aa  105  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 193 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 207 aa  94.7  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  34.95 
 
 		 211 aa  92  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2853  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 195 aa  89.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 196 aa  89.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 208 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 202 aa  84.7  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  30 
 
 		 203 aa  72  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  29.38 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  33.63 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  29.49 
 
 		 346 aa  65.9  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 176 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1940  AcrR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.682868  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6034  TetR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 307 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  36.99 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  40.58 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 182 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 125 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2859  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.111234  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 285 aa  52.8  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 238 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0684  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 197 aa  52.4  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.84339  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1167  regulatory protein TetR  34.67 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000201787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>