More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0199 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  100 
 
 		 214 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  37.56 
 
 		 214 aa  142  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  37.56 
 
 		 243 aa  141  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01016  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1131  transcriptional regulator RutR  33.33 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.33999  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2112  transcriptional regulator RutR  33.33 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  33.33 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2305  transcriptional regulator RutR  33.33 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1250  transcriptional regulator RutR  33.33 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  30.57 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1231  HTH-type transcriptional regulator RutR  30.05 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1216  HTH-type transcriptional regulator RutR  30.05 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.591915 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1081  HTH-type transcriptional regulator RutR  30.05 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1186  HTH-type transcriptional regulator RutR  30.05 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1539  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0634  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000435144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  34.29 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0639  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  hitchhiker  0.000146714 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 219 aa  62  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 224 aa  62  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4844  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 252 aa  62  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0594  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 247 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0201579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 214 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 234 aa  62  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  29.56 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4065  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4569  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000245113  hitchhiker  0.00602594 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  26.76 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  34.29 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0294  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136884  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  27.74 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2863  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  31.87 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1423  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.6699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0039  transcriptional regulator, TetR family  38.68 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618128  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  26.7 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2189  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>