More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0377 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 224 aa  464  9.999999999999999e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  35.14 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  34.64 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7459  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4603  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  33.11 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4015  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  33.11 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 215 aa  72  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  30 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 243 aa  68.2  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  27.31 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4645  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1790  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121253  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1677  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.688428  normal  0.314033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0804  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3446  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7072  putative transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1665  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.271808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1914  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000166268  normal  0.222991 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  29.48 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  35.25 
 
 		 214 aa  62  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 209 aa  62  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 228 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 219 aa  62  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  28.05 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 283 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  40.26 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  40.26 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3595  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  28.16 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  29.27 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0588  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3842  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003910  CPS_4062  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_0433  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.425009  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_3781  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_3769  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.396044  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  29.48 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
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