More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3446 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3446  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 335 aa  679    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3595  TetR family transcriptional regulator  66.77 
 
 		 313 aa  411  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0433  transcriptional regulator, TetR family  63.9 
 
 		 354 aa  319  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.425009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0418  transcriptional regulator, TetR family  63.9 
 
 		 352 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340149  hitchhiker  0.000146207 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  64.32 
 
 		 340 aa  316  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 295 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  50.58 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  50.58 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  50.58 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1677  transcriptional regulator, TetR family  52.38 
 
 		 288 aa  259  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.688428  normal  0.314033 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  52.74 
 
 		 272 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 272 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 276 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 317 aa  249  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  53.25 
 
 		 290 aa  249  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  53.36 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  53.36 
 
 		 316 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  53.36 
 
 		 316 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  53.36 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  53.36 
 
 		 316 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  53.36 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  53.36 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 229 aa  155  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 238 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0804  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 227 aa  150  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 234 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2069  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 219 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118237  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 213 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  39.08 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  39.08 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  40.72 
 
 		 222 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 225 aa  116  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 211 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  36.49 
 
 		 213 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  38.02 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 212 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 212 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 212 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 215 aa  113  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 212 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 211 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 228 aa  112  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 239 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 212 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 212 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 212 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  36.56 
 
 		 214 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  40.61 
 
 		 233 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  40.61 
 
 		 233 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  37.71 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1814  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 216 aa  107  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 235 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  40.61 
 
 		 238 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  35.09 
 
 		 207 aa  103  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3508  transcriptional regulator PsrA  40 
 
 		 238 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 235 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 235 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 235 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 235 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 235 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  40.49 
 
 		 239 aa  98.2  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  39.64 
 
 		 209 aa  92.8  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 224 aa  92.8  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1789  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 210 aa  90.9  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.461504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02639  transcriptional regulator  33.14 
 
 		 208 aa  90.1  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  32.98 
 
 		 214 aa  87  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 220 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6888  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 223 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 225 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  40 
 
 		 208 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1768  regulatory protein, TetR  38.1 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  31.11 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4603  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 240 aa  67  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0388  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  37.5 
 
 		 191 aa  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4645  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 224 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  26.99 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4548  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 247 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225011  normal  0.280375 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7459  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5743  regulatory protein TetR  46.97 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.405607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4015  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0588  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 276 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 263 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>