189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5743 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5743  regulatory protein TetR  100 
 
 		 208 aa  408  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.405607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0388  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2597  transcriptional regulator, TetR family  38.59 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127933  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3781  TetR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 235 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3769  TetR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 235 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.396044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3842  TetR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 235 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4236  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 236 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2416  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00485209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7072  putative transcriptional regulator, TetR family  41.34 
 
 		 216 aa  94.7  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1790  transcriptional regulator, TetR family  39.04 
 
 		 224 aa  94  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121253  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22730  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 216 aa  92.8  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3489  transcriptional regulator, TetR family  39.88 
 
 		 230 aa  92.8  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3897  regulatory protein, TetR  47.41 
 
 		 248 aa  88.2  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0396363  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2891  transcriptional regulator, TetR family  37.64 
 
 		 236 aa  85.1  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1768  regulatory protein, TetR  44.63 
 
 		 226 aa  85.1  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4548  TetR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225011  normal  0.280375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0301  TetR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.593617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1506  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212096  hitchhiker  0.000526239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2889  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4057  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3894  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0466911 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0521  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.769368  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3522  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2468  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 255 aa  72  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0223  regulatory protein TetR  41.51 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.029073 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2515  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.977555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  39.36 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  41 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0433  transcriptional regulator, TetR family  51.52 
 
 		 354 aa  62  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.425009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 316 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 316 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 316 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 318 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 273 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 273 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 273 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 318 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 318 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 318 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3285  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3446  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  50 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2515  transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00143422  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0418  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340149  hitchhiker  0.000146207 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  40.91 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 276 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1888  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5753  hypothetical protein  31.69 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 295 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1677  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.688428  normal  0.314033 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0804  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3294  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 255 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  35.34 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3595  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 313 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4645  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  35.34 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  38.24 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  33.01 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  33.01 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 235 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  36.13 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  40.28 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  37.78 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  35.42 
 
 		 239 aa  48.9  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  25 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2069  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118237  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1814  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 216 aa  48.1  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>