More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0382 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  485  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  84.62 
 
 		 242 aa  361  6e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  36.77 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 227 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7459  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4603  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 238 aa  99.8  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4645  TetR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 272 aa  89.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4015  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1677  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 288 aa  88.6  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.688428  normal  0.314033 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 273 aa  88.6  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 276 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 272 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0804  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 316 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 316 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 316 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 318 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 318 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 318 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 290 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal  1 
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 318 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  32.37 
 
 		 205 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1814  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0433  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.425009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  27.04 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_0418  transcriptional regulator, TetR family  28.84 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340149  hitchhiker  0.000146207 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  27.04 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_3595  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  26.58 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
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NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  30.29 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0588  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  29.14 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 263 aa  65.1  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3446  TetR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  29.05 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02639  transcriptional regulator  25.23 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  26.09 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  26.6 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  37.5 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 212 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 212 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 212 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  25.12 
 
 		 214 aa  62  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  27.91 
 
 		 227 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  52.78 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  27.09 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5610  hypothetical protein  37.11 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209551  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0392  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  27.43 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6888  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3508  transcriptional regulator PsrA  27 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
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NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
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NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
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NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
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NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  27.34 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
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