More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1637 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 193 aa  382  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 194 aa  92.8  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  38.39 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  55.17 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  55.17 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  55.17 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  55.17 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6966  TetR family transcriptional regulator  59.32 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.182707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 235 aa  62  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  37.63 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  44.87 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  28.65 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  55.17 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  50.82 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  45 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  52.63 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  38.04 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  38.2 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 247 aa  58.2  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  51.92 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  51.92 
 
 		 233 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  31.76 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4783  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.690259 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  47.37 
 
 		 214 aa  57  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>