More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6966 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6966  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  438  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.182707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  59.32 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4783  transcriptional regulator, TetR family  34.47 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.690259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  30.95 
 
 		 235 aa  62  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 186 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  52.54 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  41.67 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  27.67 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1946  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  hitchhiker  0.00972871 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  40.74 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5054  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.699739 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  57.14 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  50.82 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  46.55 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  50.82 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  46.55 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3458  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1870  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  46.03 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  42.37 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  29.58 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4603  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 372 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 198 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 198 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  50 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  50 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 291 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 202 aa  52.4  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 205 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1515  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>