More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3662 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4666  TetR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 200 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 203 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  30.17 
 
 		 207 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 217 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  29.27 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  26.55 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3937  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 238 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 232 aa  53.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 198 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 187 aa  51.6  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5376  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 445 aa  51.2  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 204 aa  51.2  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 203 aa  51.2  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  40.3 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  42.03 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 246 aa  49.3  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2545  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1703  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 106 aa  48.9  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 219 aa  48.9  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3310  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0639272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 233 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 233 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 233 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 205 aa  48.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  28.95 
 
 		 213 aa  48.1  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 189 aa  48.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 233 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 218 aa  48.1  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 222 aa  48.1  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3093  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 201 aa  47.8  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0252517 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3137  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 219 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 287 aa  47.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6888  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 254 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2765  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.829891 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  37.93 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0106  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.431172  normal  0.200565 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>