More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_13530 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 186 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0212  transcription regulator TetR/AcrR family protein  48.48 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0180  TetR/AcrR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0296493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0183  TetR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0194  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2223  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360909  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0667  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042492  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  26.47 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 403 aa  57.8  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3612  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 197 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000248131  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3389  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3352  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000543998  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3654  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.786622  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 234 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  44.07 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3605  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.02462e-25 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3621  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 197 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265617  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0794  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1614  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0287431  hitchhiker  0.0000000422838 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3301  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00420506  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3703  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0833  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0851  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 414 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 291 aa  54.7  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1501  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296827 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 299 aa  54.3  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 324 aa  54.7  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  20.21 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0851  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780744  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  43.64 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0808  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  43.64 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  43.64 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  43.64 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  43.64 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  43.64 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  43.64 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0736  transcriptional regulator  27.12 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0112088  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  52.27 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  43.64 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.59 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 309 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>