53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1501 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1501  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  411  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296827 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  20 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3810  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  36 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  22.42 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 192 aa  45.1  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  23.38 
 
 		 183 aa  45.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1668  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  40 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  23.27 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  25 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 239 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 193 aa  42.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 215 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 191 aa  42  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 215 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 210 aa  42  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 215 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  29.89 
 
 		 198 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 191 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 211 aa  41.6  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 191 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 191 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  37.74 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 194 aa  41.6  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3127  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 187 aa  41.2  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 196 aa  41.6  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  41.2  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 198 aa  41.2  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>