More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3127 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3127  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  388  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2627  transcriptional regulator, TetR family  62.37 
 
 		 186 aa  258  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  60.22 
 
 		 186 aa  241  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 193 aa  62  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  35.62 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0262  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28.72 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0261  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3760  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  27.33 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2292  intercellular adhesion regulator  32 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0364892  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4468  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 332 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  28 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25.93 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 420 aa  54.7  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  24.66 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  23.24 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  36 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 208 aa  52.4  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 248 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 208 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  36.51 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 259 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  27.22 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 205 aa  51.6  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 291 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3301  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 241 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00420506  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 213 aa  51.6  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  20.73 
 
 		 198 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  43.14 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  26.2 
 
 		 221 aa  51.6  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 220 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 218 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 200 aa  51.2  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  31.34 
 
 		 211 aa  51.2  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 210 aa  51.2  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  21.74 
 
 		 193 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  26.12 
 
 		 190 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 213 aa  51.2  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 237 aa  51.2  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 193 aa  51.2  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 190 aa  51.2  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  26.12 
 
 		 190 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0031  nucleoid occlusion protein  27.08 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2337  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000766652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  21.12 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 233 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1117  nucleoid occlusion protein  26.43 
 
 		 200 aa  50.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.862438  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 233 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  21.47 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  22.37 
 
 		 245 aa  50.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>