More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1668 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1668  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  410  1e-114  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  57.92 
 
 		 200 aa  224  7e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  57.43 
 
 		 200 aa  221  4e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 200 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 201 aa  72  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1100  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1620  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0021024  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  41.94 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  34.18 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  36.99 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1817  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0374  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.120665  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0469  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  32 
 
 		 251 aa  54.3  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  21.71 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1365  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_004310  BR0290  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547414  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  25.73 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  29.31 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  38.78 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0304  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  29.41 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0620  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5677  regulatory protein  34.15 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 297 aa  52.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 260 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  42.86 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  34.38 
 
 		 219 aa  52  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 290 aa  52  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 87 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  22.36 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 310 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 290 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 290 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 290 aa  52  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 290 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 291 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 290 aa  52  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 199 aa  52  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 207 aa  51.6  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 188 aa  51.6  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 223 aa  51.6  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 207 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 192 aa  51.2  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>