More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3827 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 190 aa  388  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1479  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 190 aa  80.9  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210194  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 286 aa  68.2  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  27.08 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 310 aa  64.7  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  26.57 
 
 		 197 aa  64.3  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3014  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1702  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 204 aa  62  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 228 aa  62  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 225 aa  62  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  27.27 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  27.33 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  23.53 
 
 		 251 aa  61.2  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8733  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153176  normal  0.242309 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  22.62 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2337  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784236 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0736  transcriptional regulator  30.47 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0112088  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  43.4 
 
 		 326 aa  58.9  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 309 aa  58.2  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  25.3 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 332 aa  58.2  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1835  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2636  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4517  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000667757  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  26.62 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>