More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2744 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  95.7 
 
 		 187 aa  352  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  90.37 
 
 		 192 aa  340  8e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  90.37 
 
 		 192 aa  340  8e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  89.84 
 
 		 192 aa  337  4e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  83.96 
 
 		 187 aa  319  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  71.12 
 
 		 189 aa  263  8e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  64.02 
 
 		 199 aa  233  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  68.11 
 
 		 198 aa  228  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  60.31 
 
 		 198 aa  223  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  59.47 
 
 		 190 aa  217  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  58.42 
 
 		 190 aa  216  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  54.26 
 
 		 190 aa  205  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  56.99 
 
 		 186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2824  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 210 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  39.24 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 205 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0237  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000134845  hitchhiker  0.00000000249443 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  27.07 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 287 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  22.58 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  45.83 
 
 		 260 aa  53.9  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 239 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  35.9 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 280 aa  53.9  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  25.98 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 206 aa  52.4  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 307 aa  52.4  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  31.69 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  40.68 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 224 aa  52.4  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 221 aa  52.4  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 310 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 233 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  23.18 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 257 aa  51.6  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 209 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>