More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6537 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 230 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 226 aa  148  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 214 aa  101  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 212 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  33.83 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  37.67 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  35.5 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  30.87 
 
 		 237 aa  91.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  35.89 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 245 aa  88.6  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 213 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 213 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 220 aa  85.5  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 208 aa  85.1  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  34.63 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  31 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  32.52 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  27.4 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  32.69 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3636  putative transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  29.22 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  34.8 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5045  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  32 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  29.41 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  30.39 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  29.67 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  26.01 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
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NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  47.76 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
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