More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22500 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  394  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  83.33 
 
 		 198 aa  313  9e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  69.15 
 
 		 189 aa  258  4e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  70.37 
 
 		 190 aa  254  6e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  70.9 
 
 		 190 aa  254  6e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  64.89 
 
 		 187 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  64.02 
 
 		 187 aa  233  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  63.49 
 
 		 192 aa  232  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  63.49 
 
 		 192 aa  232  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  62.96 
 
 		 192 aa  230  9e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  62.23 
 
 		 187 aa  229  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  62.63 
 
 		 190 aa  229  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  62.23 
 
 		 186 aa  225  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  64.17 
 
 		 198 aa  212  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 216 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  21.89 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  44.44 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  35.65 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  34.94 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  32.21 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  19.3 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  19.3 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0807  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1771  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0110  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0658  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  29.11 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2387  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3948  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  39.06 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  43.08 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 247 aa  52.8  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 247 aa  52.8  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1176  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1100  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  41.27 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1600  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  24.6 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2148  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 228 aa  52  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>