More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2701 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  486  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  86.27 
 
 		 233 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  74.36 
 
 		 233 aa  344  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4298  transcriptional regulator, TetR family  71.24 
 
 		 233 aa  335  5e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530374  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  67.81 
 
 		 233 aa  322  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3651  TetR family transcriptional regulator  66.52 
 
 		 233 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2845  TetR family transcriptional regulator  65.67 
 
 		 233 aa  295  6e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 204 aa  85.9  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0667  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042492  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2875  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  31.54 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2589  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0467088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2550  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2595  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3014  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00422654  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 197 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  45.9 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 271 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 192 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 330 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 189 aa  53.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  29.46 
 
 		 207 aa  52.8  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0970  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 203 aa  52.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 187 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 235 aa  52.4  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0290  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 198 aa  52.4  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 229 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0799  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 225 aa  52  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126774  normal  0.374704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 211 aa  52  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 190 aa  52  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 200 aa  52  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6854  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.101929  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1158  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  28.29 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  45.28 
 
 		 198 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 190 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5181  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.752009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  29.23 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  31.91 
 
 		 200 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 200 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>