More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2845 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2845  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  68.24 
 
 		 233 aa  314  8e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4298  transcriptional regulator, TetR family  68.24 
 
 		 233 aa  311  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530374  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  65.67 
 
 		 233 aa  301  5.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  65.67 
 
 		 233 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  67.58 
 
 		 239 aa  300  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3651  TetR family transcriptional regulator  63.95 
 
 		 233 aa  288  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2589  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0467088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2550  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2595  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  47.54 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0667  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042492  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 125 aa  52.4  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6854  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.101929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 197 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3503  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 186 aa  52  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 200 aa  52  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 206 aa  52  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 217 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 209 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  34.92 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 184 aa  50.1  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 197 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0290  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 198 aa  50.1  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0048  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 187 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  32.31 
 
 		 226 aa  49.3  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  29.36 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 182 aa  48.9  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 245 aa  48.9  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  38.6 
 
 		 198 aa  48.9  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 330 aa  48.9  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 205 aa  48.9  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 141 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 423 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  38.6 
 
 		 187 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>