More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2595 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2550  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2595  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2589  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0467088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  80.73 
 
 		 234 aa  355  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0365  TetR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0217747  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4298  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530374  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 414 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3651  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6854  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.101929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  39.84 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  53.19 
 
 		 423 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2845  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  31.2 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0194  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  35.92 
 
 		 224 aa  52  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  32 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0667  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042492  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0735  regulatory protein, TetR  32.84 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0212  transcription regulator TetR/AcrR family protein  40.45 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  23 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0180  TetR/AcrR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0296493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0183  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  27.64 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  24.88 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 263 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 421 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 233 aa  49.3  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 291 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 403 aa  48.9  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  43.1 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2564  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 214 aa  48.5  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.454515 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 227 aa  48.5  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 255 aa  48.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 197 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 222 aa  48.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 234 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>