More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0667 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0667  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042492  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5853  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161572 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2019  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3651  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4298  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530374  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4951  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717286  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1454  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1292  regulatory protein TetR  28.12 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3273  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 226 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0553  TetR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 233 aa  52  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  39.68 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  33.78 
 
 		 254 aa  52  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3163  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  20.54 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2550  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  52.17 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3562  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  20.5 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2595  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2589  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0467088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2845  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1381  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.637245  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1812  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  35 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  21.47 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  39.06 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>