More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2395 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
205 aa  399  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  46.39 
 
 
206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  44.85 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  43.59 
 
 
215 aa  158  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  42.13 
 
 
204 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  42.13 
 
 
204 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  42.13 
 
 
204 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  46.46 
 
 
196 aa  148  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 
198 aa  136  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  40.41 
 
 
203 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 
198 aa  125  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  41 
 
 
211 aa  122  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 
219 aa  115  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 
220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  44.92 
 
 
202 aa  108  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
227 aa  106  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 
200 aa  98.6  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
211 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  38.25 
 
 
197 aa  94  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
208 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
235 aa  92.4  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  34.34 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  37.23 
 
 
216 aa  85.5  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
193 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
193 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
193 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 
185 aa  77.8  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
187 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  29.29 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
215 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 
208 aa  62.8  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 
193 aa  59.3  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 
204 aa  58.5  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
240 aa  58.5  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 
233 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 
189 aa  58.2  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
226 aa  58.2  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
234 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 
225 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 
218 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  45.57 
 
 
271 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 
194 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
250 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  44.59 
 
 
225 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
210 aa  55.8  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
227 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2247  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
227 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
220 aa  55.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 
214 aa  55.5  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 
225 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 
242 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  49.25 
 
 
242 aa  55.1  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 
245 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
218 aa  55.1  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
222 aa  55.1  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  48.1 
 
 
233 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 
214 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 
227 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.853887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
223 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4569  TetR family transcriptional regulator  37.39 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000147437  normal  0.0336832 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
220 aa  53.9  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4666  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
200 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 
242 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  35.21 
 
 
224 aa  53.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0204514 
 
 
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NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 
223 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007348  Reut_B3988  regulatory protein, TetR  38.74 
 
 
233 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
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NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
239 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
238 aa  53.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 
261 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
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NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  41.94 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
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NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
204 aa  52.8  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
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NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 
224 aa  52.8  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal 
 
 
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NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
217 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568004 
 
 
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NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
207 aa  52.8  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
258 aa  52.4  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
190 aa  52.8  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
217 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.110099 
 
 
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NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
222 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000381229 
 
 
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NC_008578  Acel_0290  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
198 aa  52.4  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
218 aa  52.4  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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