More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0576 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 210 aa  407  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  47.67 
 
 		 215 aa  175  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  51.78 
 
 		 198 aa  165  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  45.92 
 
 		 196 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  44.33 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  39 
 
 		 207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 211 aa  131  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  39.49 
 
 		 209 aa  127  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  37.19 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  41.88 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 200 aa  118  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 202 aa  118  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  38.07 
 
 		 194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 227 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  38.17 
 
 		 198 aa  106  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  43.89 
 
 		 185 aa  105  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 197 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  34.92 
 
 		 216 aa  101  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 193 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 193 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 193 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 211 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  31.16 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3055  transcriptional regulator, TetR family  38.59 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  58 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  47.89 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 203 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  52.73 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  56.14 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  37.62 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  45.95 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4783  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.690259 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>